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SG ID |
SG00000513 |
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UniProt Accession |
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Theoretical PI |
7.03
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Molecular Weight |
68138 Da
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Genbank Nucleotide ID |
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Genbank Protein ID |
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Gene Name |
RPA1 |
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Gene Synonyms/Alias |
REPA1, RPA70 |
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Protein Name |
Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit |
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Protein Synonyms/Alias |
RP-A p70 Replication factor A protein 1;RF-A protein 1 Single-stranded DNA-binding protein; |
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Organism |
Homo sapiens (Human) |
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NCBI Taxonomy ID |
9606 |
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Chromosome Location |
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Function in Stage |
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Function in Cell Type |
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Description |
Replication protein A (RPA) has been identified as a component of early recombination nodules. The visualization of post-synaptic RPA foci may indicate the presence of a different role for this protein during homologous recombination. |
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The information of related literatures |
1. M. Oliver-Bonet, M. Campillo, P. J. Turek, E. Ko and R. H. Martin (2007) Analysis of replication protein A (RPA) in human spermatogenesis. Mol Hum Reprod 13(12): 837-44. Abstract Replication protein A (RPA) has been identified as a component of early recombination nodules. It is thought to stimulate homologous pairing and strand exchange reactions. The expression pattern of RPA in human spermatocytes has been analysed using immunocytogenetic techniques on testicular biopsies from adult male patients. What appears to be connecting RPA-filaments was observed between as yet unsynapsed homologous regions at early stages of zygotene. RPA foci were also observed in synaptic segments at zygotene and early pachytene, in numbers that peak at the end of zygotene. The presence of a localization pattern for RPA was also detected, but statistical analysis of distances between adjacent RPA foci shows that this pattern does not always follow a gamma distribution. Finally, it was determined that RPA is absent from non-centromeric heterochromatin in chromosome 9. The observed bridge-like structure could be the visualization of a proposed pre-synaptic RPA role in the strand invasion that precedes the formation of a Holliday Junction. These observations strengthen the original pre-synaptic model, although the visualization of post-synaptic RPA foci may indicate the presence of a different role for this protein during homologous recombination. PMID: [17981954] Back to Top |
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Figures for illustrating the function of this protein/gene |
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Function |
Functions as component of the alternative replicationprotein A complex (aRPA). aRPA binds single-stranded DNA andprobably plays a role in DNA repair; it does not supportchromosomal DNA replication and cell cycle progression through S-phase. In vitro, aRPA cannot promote efficient priming by DNApolymerase alpha but supports DNA polymerase delta synthesis inthe presence of PCNA and replication factor C (RFC), the dualincision/excision reaction of nucleotide excision repair andRAD51-dependent strand exchange. Back to Top |
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Subcellular Location |
Nucleus. |
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Tissue Specificity |
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Gene Ontology |
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Interpro |
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Pfam |
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SMART |
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PROSITE |
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PRINTS |
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Created Date |
18-Oct-2012 |
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Record Type |
Experiment identified |
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Protein sequence Annotation |
INIT_MET 1 1 Removed. CHAIN 2 616 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit. /FTId=PRO_0000097260. ZN_FING 481 503 C4-type (Potential). MOD_RES 163 163 N6-acetyllysine. MOD_RES 167 167 N6-acetyllysine. MOD_RES 180 180 Phosphothreonine. MOD_RES 191 191 Phosphothreonine. MOD_RES 259 259 N6-acetyllysine. MOD_RES 384 384 Phosphoserine. CROSSLNK 449 449 Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO). CROSSLNK 577 577 Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO). VARIANT 351 351 T -> A (in dbSNP:rs5030755). /FTId=VAR_019236. MUTAGEN 41 41 R->E: Loss of HELB-binding; when associated with E-43. MUTAGEN 43 43 R->E: Loss of HELB-binding; when associated with E-41. MUTAGEN 449 449 K->R: Significant reduction of sumoylation. Loss of sumoylation; when associated with R-577. MUTAGEN 577 577 K->R: Slight sumoylation decrease. Loss of sumoylation; when associated with R- 449. HELIX 2 4 HELIX 9 16 STRAND 18 20 STRAND 24 33 STRAND 36 38 STRAND 41 47 STRAND 49 58 HELIX 60 62 HELIX 63 67 STRAND 70 74 STRAND 76 86 STRAND 88 90 STRAND 92 103 HELIX 105 108 HELIX 187 189 STRAND 198 206 STRAND 210 213 STRAND 218 227 STRAND 232 238 HELIX 239 245 HELIX 246 248 STRAND 254 258 STRAND 261 264 HELIX 267 269 STRAND 275 279 STRAND 285 288 HELIX 305 310 STRAND 316 326 STRAND 330 334 TURN 335 338 STRAND 339 349 STRAND 355 361 HELIX 362 367 STRAND 375 384 STRAND 388 392 STRAND 398 402 HELIX 406 416 TURN 417 419 HELIX 445 451 TURN 452 454 STRAND 455 458 STRAND 460 471 STRAND 477 480 STRAND 491 493 TURN 494 496 STRAND 497 500 TURN 501 504 STRAND 505 509 STRAND 512 521 STRAND 526 532 HELIX 533 540 HELIX 544 550 HELIX 555 564 TURN 565 567 STRAND 569 577 STRAND 588 596 HELIX 599 615 Back to Top |
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Nucleotide Sequence |
Length: 2393 bp Go to nucleotide: FASTA |
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Protein Sequence |
Length: 616 bp Go to amino acid: FASTA |
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The verified Protein-Protein interaction information |
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Other Protein-Protein interaction resources |
String database |
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View Microarray data |
Temporarily unavailable |
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Comments |
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