Chr Position LOD score Is GP compatible Is marker 302_Male_Control Quality;R|A_302_Male_Control 401_Male_Control Quality;R|A_401_Male_Control 402_Male_Patient Quality;R|A_402_Male_Patient 10 94026 -3.27 Y N Het;G>A 928;72|43 Het;G>A 1081;90|54 Hom;G>A 3257;2|121 10 94083 -3.27 Y N Het;C>T 1346;6|45 Het;C>T 1323;9|48 Hom;C>T 1223;4|44 10 94426 -3.27 Y N Het;C>T 1115;23|40 Het;C>T 390;35|16 Hom;C>T 1466;1|48 10 94870 -3.27 Y N Het;A>G 2264;69|61 Het;A>G 1492;67|41 Hom;A>G 3255;0|74 10 94872 -3.27 Y N Het;A>C 2264;67|58 Het;A>C 1492;65|41 Hom;A>C 3255;0|72 10 95074 -3.27 Y N Het;G>A 286;13|12 Het;G>A 205;13|10 Hom;G>A 623;0|21 10 128829 -3.27 Y N Het;A>G 279;3|10 Het;A>G 40;5|3 Hom;A>G 274;0|10 10 131979 -3.27 Y N Het;C>T 557;13|17 Het;C>T 253;10|9 Hom;C>T 362;0|12 10 329188 -3.27 Y N Het;G>T 2225;32|55 Het;G>T 1197;36|32 Hom;G>T 3254;0|70 10 329191 -3.27 Y N Het;-C 2232;34|58 Het;-C 1185;37|32 Hom;-C 3245;0|75 10 785525 -3.27 Y N Het;-TGTG 842;45|25 Het;-TGTG 567;31|19 Hom;-TGTG 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734;0|26 10 27401056 -1.72 Y N Het;C>T 1465;51|63 Het;C>T 799;52|39 Hom;C>T 2426;0|86 10 27404927 -1.72 Y N Het;G>T 279;9|12 Het;G>T 320;6|12 Hom;G>T 603;0|18 10 27405096 -1.72 Y N Het;A>G 1683;51|69 Het;A>G 1112;63|48 Hom;A>G 4161;0|147 10 27405360 -1.72 Y N Het;+C 299;14|11 Het;+C 67;10|4 Hom;+C 1048;0|29 10 27412669 -1.72 Y N Het;A>T 115;19|8 Het;A>T 412;16|21 Hom;A>T 1429;0|56 10 27423744 -1.72 Y N Het;T>C 947;73|47 Het;T>C 1318;57|63 Hom;T>C 3782;1|136 10 27425442 -1.72 Y N Het;G>A 406;9|14 Het;G>A 411;8|14 Hom;G>A 484;0|15 10 27434483 -1.71 Y N Het;G>A 2695;119|128 Het;G>A 2674;92|122 Hom;G>A 6311;0|241 10 27434674 -1.71 Y N Het;C>T 400;8|13 Het;C>T 64;3|3 Hom;C>T 231;0|7 10 27437994 -1.71 Y N Het;C>T 1110;51|47 Het;C>T 1115;33|45 Hom;C>T 2694;0|92 10 27508758 -1.71 N Y Het;T>C 1334;58|61 Het;T>C 1048;58|52 Ref 10 28812514 -2.36 Y N Het;T>G 916;21|50 Het;T>G 805;21|43 Hom;T>G 586;3|27 10 28821216 -2.36 N Y Het;G>A 994;35|40 Ref Het;G>A 1011;39|50 10 29219347 -2.31 N Y Het;A>G 101;6|5 Ref Ref 10 29519285 -2.58 Y N Het;C>A 195;10|7 Het;C>A 214;4|8 Hom;C>A 404;0|12 10 29519567 -2.58 Y N Het;A>G 126;11|5 Ref Hom;A>G 258;0|7 10 29577924 -2.67 Y N Het;G>C 269;4|9 Het;G>C 175;9|6 Hom;G>C 134;0|4 10 29578084 -2.67 Y N Het;A>G 1360;111|69 Het;A>G 782;112|43 Hom;A>G 3581;0|139 10 29782066 -3.02 Y N Het;A>G 179;8|7 Het;A>G 247;10|8 Hom;A>G 469;0|12 10 29783813 -3.02 Y N Het;G>A 305;16|12 Het;G>A 293;13|11 Hom;G>A 396;0|13 10 29822159 -3.09 N Y Ref Het;T>C 1813;83|74 Het;T>C 2274;97|105 10 29941058 -2.68 N Y Ref Het;C>G 750;32|33 Het;C>G 845;51|40 10 29991278 -2.49 Y N Het;+TCT 306;24|15 Het;+TCT 561;17|26 Hom;+TCT 2552;0|58 10 30653561 -2.67 N Y Hom;C>G 6232;0|206 Hom;C>G 4753;0|159 Het;C>G 1924;84|88 10 30657716 -2.68 Y N Het;G>A 102;6|5 Ref Hom;G>A 105;0|5 10 30658517 -2.68 Y N Het;C>T 1029;56|48 Ref Hom;C>T 2165;0|76 10 30660798 -2.68 Y N Het;C>T 871;26|36 Ref Hom;C>T 1406;0|46 10 30662734 -2.68 Y N Het;G>C 116;8|7 Ref Hom;G>C 141;0|5 10 30915571 -2.70 Y N Het;C>T 324;11|10 Ref Hom;C>T 548;0|16 10 30915590 -2.70 Y N Het;T>C 806;8|23 Het;T>C 542;6|19 Hom;T>C 687;0|21 10 30974174 -2.70 N Y Het;T>C 343;21|17 Ref Het;T>C 423;12|19 10 32106851 -2.16 N Y Ref Ref Het;A>G 893;28|42 10 33467108 -1.61 Y N Het;G>A 1661;70|75 Ref Hom;G>A 5109;1|189 10 33468014 -1.61 Y Y Het;T>C 1131;60|43 Ref Hom;T>C 3490;2|124 10 33481478 -1.60 Y N Het;A>G 103;3|4 Ref Hom;A>G 144;0|5 10 33492093 -1.60 Y N Het;A>G 69;2|3 Ref Hom;A>G 173;0|5 10 34408745 -1.90 N Y Het;A>C 837;19|32 Ref Het;A>C 408;16|19 10 35930412 -2.46 Y N Het;+G 328;24|19 Ref Hom;+G 651;0|26 10 36088377 -2.41 N Y Het;A>C 2527;126|101 Ref Het;A>C 2491;104|122 10 36339870 -2.30 Y N Het;T>C 130;12|7 Ref Hom;T>C 817;0|32 10 42393827 -2.54 Y N Het;A>G 338;4|16 Het;A>G 739;4|34 Hom;A>G 740;4|30 10 42661204 -2.55 Y N Het;G>A 2103;4|52 Het;G>A 3645;15|90 Hom;G>A 6195;10|150 10 42661225 -2.55 Y N Het;C>T 2059;4|50 Het;C>T 3709;14|90 Hom;C>T 6161;10|147 10 42661304 -2.55 Y N Het;T>G 593;2|13 Het;T>G 1091;5|27 Hom;T>G 1502;0|29 10 42661326 -2.55 Y N Het;G>A 53;1|2 Het;G>A 506;4|13 Hom;G>A 512;0|11 10 42836036 -2.56 N Y Het;G>C 324;20|14 Ref Het;G>C 191;13|12 10 43595836 -2.59 Y N Het;+T 216;5|13 Het;+T 330;6|20 Hom;+T 355;2|18 10 44362711 -2.51 N Y Het;T>C 1586;88|70 Hom;T>C 3363;1|120 Het;T>C 1142;89|57 10 46215431 -2.52 N Y Het;A>G 1639;102|72 Hom;A>G 4048;0|141 Het;A>G 1537;90|70 10 46918075 -1.75 Y N Het;T>C 178;1|6 Het;T>C 74;3|4 Hom;T>C 324;0|9 10 46968762 -1.63 N Y Het;C>G 4010;46|149 Het;C>G 3064;52|126 Het;C>G 3336;55|132 10 46968950 -1.63 Y N Het;A>G 484;4|12 Het;A>G 292;3|7 Hom;A>G 512;0|12 10 47007669 -1.53 Y N Het;T>G 221;5|10 Het;T>G 212;3|8 Hom;T>G 251;0|10 10 47668858 -0.56 N Y Het;T>A 276;10|10 Ref Ref 10 48426798 -1.87 N Y Het;C>T 581;33|27 Het;C>T 280;26|15 Het;C>T 602;39|28 10 49659637 -2.48 N Y Het;T>C 1300;62|51 Ref Het;T>C 888;57|41 10 50155130 -2.60 N Y Het;C>T 1008;27|35 Het;C>T 814;25|30 Het;C>T 726;24|26 10 50746923 -2.36 Y N Het;C>A 251;18|10 Ref Hom;C>A 450;0|11 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Hom;G>A 668;0|24 10 64112690 -1.75 Y N Het;G>A 460;45|27 Ref Hom;G>A 2146;2|82 10 64136710 -1.76 Y N Het;-AG 1273;28|34 Ref Hom;-AG 1457;2|37 10 64415184 -1.88 Y N Het;A>G 1524;81|67 Het;A>G 1564;71|72 Hom;A>G 3628;0|129 10 64415413 -1.88 N Y Ref Het;T>A 506;34|21 Ref 10 64776283 -2.06 Y N Het;C>A 121;3|5 Ref Hom;C>A 95;0|4 10 64927823 -2.14 N Y Het;C>G 1690;43|71 Het;C>G 1717;115|84 Het;C>G 2000;101|92 10 66784100 -2.54 N Y Ref Het;T>C 240;12|14 Het;T>C 273;12|15 10 66834242 -2.54 Y N Het;-TTTTTTA 290;3|8 Het;-TTTTTTA 164;3|5 Hom;-TTTTTTA 323;0|8 10 66834252 -2.54 Y N Het;+CAAAA 290;3|8 Het;+CAAAA 164;3|5 Hom;+CAAAA 323;0|8 10 66884210 -2.54 Y N Het;A>G 171;7|6 Het;A>G 73;2|3 Hom;A>G 378;0|11 10 67526347 -2.46 Y N Het;-T 369;14|12 Ref Hom;-T 1379;0|35 10 67526382 -2.46 Y N Het;G>C 61;11|4 Ref Hom;G>C 448;0|13 10 68187295 -2.34 Y Y Het;A>C 225;8|9 Ref Hom;A>C 1790;0|64 10 68187490 -2.34 Y N Het;G>T 109;3|5 Ref Hom;G>T 408;0|13 10 68187518 -2.34 Y N Het;T>C 128;2|4 Ref Hom;T>C 264;0|7 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2284;0|81 Het;A>G 699;48|33 Het;A>G 725;39|33 10 72513682 -2.68 N Y Ref Ref Het;C>T 1137;46|57 10 72520330 -2.68 Y N Het;A>G 3159;126|131 Ref Hom;A>G 6882;3|242 10 72533910 -2.68 Y N Het;C>T 631;33|28 Het;C>T 730;36|34 Hom;C>T 1413;0|50 10 72534212 -2.68 Y N Het;C>T 196;8|7 Het;C>T 151;6|7 Hom;C>T 299;0|12 10 72536779 -2.68 Y N Het;A>C 295;5|9 Ref Hom;A>C 172;0|5 10 72537450 -2.68 Y N Het;T>C 213;9|9 Het;T>C 112;2|6 Hom;T>C 347;0|14 10 72636450 -2.67 Y N Het;T>G 414;21|18 Het;T>G 262;26|15 Hom;T>G 1117;0|37 10 72643671 -2.67 Y N Het;C>T 547;27|25 Het;C>T 368;26|17 Hom;C>T 1050;0|39 10 72715367 -2.67 Y N Het;G>T 202;33|14 Het;G>T 207;21|11 Hom;G>T 622;0|25 10 73008857 -2.66 N Y Het;A>C 1051;48|50 Het;A>C 727;57|36 Het;A>C 1046;42|48 10 73047690 -2.66 Y N Het;C>T 165;8|6 Ref Hom;C>T 166;0|5 10 73199501 -2.65 Y N Het;C>A 223;6|9 Ref Hom;C>A 264;0|10 10 73206287 -2.65 Y N Het;C>T 78;1|3 Ref Hom;C>T 116;0|4 10 73403490 -2.64 Y N Het;A>G 75;6|4 Ref Hom;A>G 99;0|4 10 73499561 -2.63 N Y Het;C>G 575;29|23 Hom;C>G 1589;0|52 Het;C>G 372;18|17 10 73724266 -2.63 Y N Het;C>G 426;17|20 Het;C>G 334;17|17 Hom;C>G 973;0|37 10 73765773 -2.63 Y N Het;T>G 372;20|17 Het;T>G 364;15|20 Hom;T>G 619;0|26 10 73767859 -2.63 Y N Het;G>A 1391;86|60 Het;G>A 1447;72|60 Hom;G>A 3212;0|117 10 73769507 -2.63 Y N Het;C>T 1490;62|62 Het;C>T 825;50|40 Hom;C>T 3055;0|112 10 73769590 -2.63 Y Y Het;C>T 1152;51|51 Het;C>T 1030;51|49 Hom;C>T 2360;0|81 10 73770117 -2.63 Y N Het;T>C 586;11|20 Het;T>C 305;14|13 Hom;T>C 976;0|32 10 73771706 -2.63 Y N Het;G>A 705;35|31 Het;G>A 1110;42|49 Hom;G>A 1890;0|69 10 73772014 -2.63 Y N Het;G>A 716;48|31 Het;G>A 767;70|35 Hom;G>A 2411;0|87 10 73772336 -2.63 Y N Het;T>C 1190;59|55 Het;T>C 979;52|45 Hom;T>C 1395;2|53 10 73772762 -2.63 Y N Het;C>T 906;61|43 Het;C>T 1073;58|54 Hom;C>T 2711;0|103 10 73773014 -2.63 Y N Het;G>A 926;40|41 Het;G>A 721;39|37 Hom;G>A 1259;2|49 10 73822243 -2.63 Y N Het;G>T 75;3|4 Ref Hom;G>T 122;0|4 10 73822507 -2.63 Y N Het;C>T 800;54|41 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410;10|13 Ref Hom;T>C 314;0|10 10 99422648 -2.16 Y N Het;A>G 794;20|37 Het;A>G 781;36|34 Hom;A>G 1804;0|69 10 99426975 -2.17 Y N Het;C>T 49;6|5 Ref Hom;C>T 434;1|19 10 99437822 -2.17 Y N Het;A>G 793;37|37 Het;A>G 485;19|18 Hom;A>G 1233;0|48 10 99439541 -2.17 Y N Het;G>C 2340;85|97 Het;G>C 1705;78|77 Hom;G>C 4026;1|135 10 99439703 -2.17 Y N Het;A>T 1308;68|53 Het;A>T 1332;48|35 Hom;A>T 2666;0|73 10 99439724 -2.17 Y N Het;C>T 921;52|38 Het;C>T 347;42|19 Hom;C>T 1549;0|56 10 99589391 -2.21 N Y Hom;T>C 3902;0|141 Het;T>C 1308;76|63 Hom;T>C 3346;0|128 10 100193515 -2.40 Y N Het;G>A 199;4|7 Ref Hom;G>A 114;0|4 10 100193526 -2.40 Y N Het;A>C 236;5|8 Ref Hom;A>C 141;0|4 10 100193557 -2.40 Y N Het;T>C 398;6|13 Ref Hom;T>C 294;0|8 10 100193883 -2.40 Y N Het;C>T 460;30|21 Ref Hom;C>T 1126;0|41 10 100193958 -2.40 Y N Het;A>G 110;7|5 Ref Hom;A>G 80;0|3 10 100195583 -2.40 Y N Het;T>A 625;21|22 Ref Hom;T>A 1135;0|37 10 100219314 -2.41 N Y Ref Ref Het;G>A 930;32|39 10 100991971 -2.59 Y N Het;-ACAC 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123;1|4 Het;A>G 231;1|7 Hom;A>G 185;0|6 10 114101508 -2.63 Y N Het;+A 428;15|23 Het;+A 825;7|41 Hom;+A 1192;5|55 10 114807047 -2.64 N Y Ref Het;G>C 1075;70|58 Het;G>C 963;67|48 10 115370254 -2.70 N Y Het;A>G 1948;66|55 Het;A>G 2326;61|64 Het;A>G 2115;78|59 10 115439530 -2.71 Y N Het;G>C 83;16|6 Het;G>C 145;13|9 Hom;G>C 476;0|18 10 115481018 -2.71 Y N Het;C>T 416;16|17 Het;C>T 346;7|15 Hom;C>T 746;0|22 10 116032519 -2.74 N Y Hom;A>G 1036;0|34 Hom;A>G 1531;2|54 Het;A>G 381;26|20 10 116073801 -2.69 Y N Het;T>C 866;45|38 Het;T>C 753;28|35 Hom;T>C 2220;2|80 10 116132246 -2.61 N Y Hom;C>T 1099;0|36 Het;C>T 490;15|21 Het;C>T 153;21|10 10 116756226 -2.18 Y N Het;C>G 840;95|48 Het;C>G 797;73|45 Hom;C>G 2773;4|105 10 117228946 -2.12 Y N Het;C>T 87;3|4 Het;C>T 54;4|3 Hom;C>T 275;0|9 10 117308880 -2.10 Y N Het;A>G 175;12|7 Het;A>G 186;7|6 Hom;A>G 829;0|23 10 117309098 -2.10 Y N Het;G>A 142;23|10 Het;G>A 654;19|26 Hom;G>A 1570;0|57 10 117856379 -2.03 Y N Het;-GCACAC 347;3|12 Het;-GCACAC 575;2|15 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Het;C>G 683;28|27 Ref Hom;C>G 696;0|23 10 134898842 -2.46 Y Y Het;T>C 1069;84|53 Het;T>C 2630;72|71 Hom;T>C 3329;0|118 10 134899928 -2.46 Y N Het;A>G 530;18|18 Ref Hom;A>G 407;0|12 10 134902314 -2.46 Y N Het;A>G 198;11|9 Het;A>G 114;4|6 Hom;A>G 459;0|16 10 134902396 -2.46 Y N Het;C>G 421;25|23 Het;C>G 625;23|31 Hom;C>G 2416;0|54 10 134916121 -2.46 Y N Het;T>A 484;17|20 Het;T>A 164;7|6 Hom;T>A 710;0|23 10 135053123 -2.53 Y N Het;A>G 553;20|23 Ref Hom;A>G 1121;0|42 10 135054523 -2.53 Y N Het;G>A 592;18|22 Ref Hom;G>A 932;0|33 10 135054904 -2.53 Y N Het;T>C 157;18|9 Ref Hom;T>C 1276;0|48 10 135179363 -2.59 Y N Het;G>C 69;5|3 Ref Hom;G>C 282;0|8 10 135267445 -2.50 Y N Het;T>C 1031;45|50 Het;T>C 819;35|37 Hom;T>C 2047;0|76 10 135267738 -2.50 Y N Het;T>C 65;3|3 Het;T>C 61;4|3 Hom;T>C 167;0|6 10 135271598 -2.48 Y N Het;T>C 2858;112|118 Het;T>C 1737;114|80 Hom;T>C 5928;0|207 10 135271789 -2.48 Y N Het;C>T 2582;109|109 Het;C>T 1893;87|84 Hom;C>T 5495;0|199 10 135273463 -2.47 Y N Het;C>G 853;47|33 Het;C>G 1143;39|43 Hom;C>G 2213;0|77 10 135278193 -2.44 Y N Het;A>G 1470;70|67 Het;A>G 1731;88|82 Hom;A>G 4616;2|175 10 135279810 -2.44 Y N Het;T>G 1256;95|56 Het;T>G 1645;91|81 Hom;T>G 4150;1|148 10 135280765 -2.43 Y N Het;C>T 1799;85|81 Het;C>T 1673;101|78 Hom;C>T 3678;0|139 10 135381927 -1.90 N Y Het;T>G 493;51|29 Hom;T>G 1161;0|43 Het;T>G 520;42|29 10 135383366 -1.89 Y N Het;C>T 2412;71|105 Ref Hom;C>T 2512;7|105