Chr Position LOD score Is GP compatible Is marker 302_Male_Control Quality;R|A_302_Male_Control 401_Male_Control Quality;R|A_401_Male_Control 402_Male_Patient Quality;R|A_402_Male_Patient 12 86364 -0.83 Y N Het;T>C 630;10|24 Ref Hom;T>C 709;1|29 12 311949 -0.83 N Y Het;A>G 1666;66|71 Het;A>G 1374;52|61 Ref 12 319111 -0.85 Y N Het;T>C 1646;85|79 Het;T>C 1664;85|80 Hom;T>C 4268;1|156 12 319125 -0.85 Y N Het;A>G 1537;83|68 Het;A>G 1513;74|70 Hom;A>G 3965;0|139 12 461598 -1.21 Y N Het;C>A 256;5|10 Het;C>A 65;8|4 Hom;C>A 414;0|12 12 464254 -1.22 Y N Het;T>C 225;16|10 Het;T>C 261;8|10 Hom;T>C 1125;0|37 12 495217 -1.30 Y N Het;G>T 306;13|14 Het;G>T 135;10|8 Hom;G>T 487;0|17 12 540994 -1.42 Y N Het;A>G 982;41|36 Het;A>G 980;34|38 Hom;A>G 1344;0|44 12 675441 -1.75 N Y Het;T>A 620;14|25 Ref Het;T>A 243;16|11 12 863517 -1.95 Y N Het;G>A 705;59|32 Het;G>A 602;17|26 Hom;G>A 2500;0|94 12 936468 -2.03 Y N Het;C>G 486;26|20 Het;C>G 432;18|16 Hom;C>G 1459;0|45 12 939302 -2.04 Y N Het;A>G 730;59|35 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Het;G>T 745;59|38 Hom;G>T 2362;0|88 12 31213735 -0.97 Y N Het;C>T 415;30|22 Het;C>T 397;24|17 Hom;C>T 1096;0|40 12 31226440 -0.97 Y N Het;A>G 806;67|39 Het;A>G 536;60|28 Hom;A>G 2343;2|85 12 31226835 -0.97 Y N Het;T>A 1882;55|74 Het;T>A 1301;66|55 Hom;T>A 2573;0|89 12 31227175 -0.97 Y N Het;-CAG 190;4|6 Het;-CAG 188;9|6 Hom;-CAG 311;0|8 12 31237026 -0.97 Y N Het;A>G 621;63|29 Het;A>G 736;37|34 Hom;A>G 1653;0|54 12 31237372 -0.97 Y N Het;A>T 219;16|11 Het;A>T 223;11|9 Hom;A>T 549;0|17 12 31237700 -0.97 Y N Het;G>A 716;24|26 Het;G>A 634;17|22 Hom;G>A 756;0|24 12 31238075 -0.97 Y N Het;G>A 2057;154|96 Het;G>A 1969;99|94 Hom;G>A 6223;4|228 12 31240862 -0.97 Y N Het;A>T 1213;138|60 Het;A>T 1827;93|74 Hom;A>T 3368;1|115 12 31240925 -0.97 Y N Het;A>G 1277;159|68 Het;A>G 1901;113|93 Hom;A>G 4363;0|163 12 31240960 -0.97 Y N Het;G>A 1335;108|66 Het;G>A 1864;94|89 Hom;G>A 4270;0|161 12 31242271 -0.97 Y N Het;G>A 727;30|27 Het;G>A 653;22|23 Hom;G>A 1058;0|30 12 31242314 -0.97 Y N Het;T>C 768;49|32 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-0.98 Y N Het;C>G 173;3|5 Het;C>G 110;10|4 Hom;C>G 332;0|8 12 31258728 -0.98 Y N Het;C>T 216;3|7 Het;C>T 110;10|4 Hom;C>T 357;0|9 12 31258947 -0.98 Y N Het;C>A 62;5|3 Het;C>A 118;2|5 Hom;C>A 110;0|5 12 31259027 -0.98 Y N Het;+AGGT 134;13|5 Het;+AGGT 413;4|11 Hom;+AGGT 413;0|10 12 31263633 -0.98 Y N Het;T>C 457;52|26 Het;T>C 1481;34|39 Hom;T>C 1632;2|44 12 31263635 -0.98 Y N Het;T>C 1366;45|50 Het;T>C 1529;33|39 Hom;T>C 2926;1|66 12 31263637 -0.98 Y N Het;T>C 2128;43|53 Het;T>C 1529;33|39 Hom;T>C 2976;1|65 12 31263639 -0.98 Y N Het;T>C 2068;42|51 Het;T>C 1547;34|37 Hom;T>C 2937;1|65 12 31263752 -0.98 Y N Het;A>C 243;36|14 Het;A>C 942;22|25 Hom;A>C 1523;0|40 12 31264743 -0.98 Y N Het;C>T 1042;64|48 Het;C>T 785;46|37 Hom;C>T 2547;0|95 12 31264770 -0.98 Y N Het;A>G 787;56|34 Het;A>G 518;40|24 Hom;A>G 1606;0|52 12 31265872 -0.98 Y N Het;C>T 78;3|6 Het;C>T 83;4|5 Hom;C>T 198;0|8 12 31265925 -0.98 Y N Het;C>G 160;7|8 Het;C>G 165;7|8 Hom;C>G 453;0|18 12 31265983 -0.98 Y N Het;G>A 197;6|10 Het;G>A 128;6|8 Hom;G>A 368;0|15 12 31266042 -0.98 Y N Het;C>T 135;1|7 Het;C>T 84;3|5 Hom;C>T 141;0|6 12 31267744 -0.98 Y N Het;A>C 167;25|11 Ref Hom;A>C 500;0|20 12 31270149 -0.98 Y N Het;G>C 110;10|4 Ref Hom;G>C 134;0|4 12 31270150 -0.98 Y N Het;C>A 110;10|4 Ref Hom;C>A 134;0|4 12 31270171 -0.98 Y N Het;T>C 74;8|3 Ref Hom;T>C 189;0|6 12 31595978 -1.00 Y N Het;+TG 249;1|9 Het;+TG 252;1|9 Hom;+TG 69;0|3 12 31648826 -1.00 N Y Het;C>T 1563;81|71 Hom;C>T 4309;0|153 Ref 12 32795421 -1.90 N Y Hom;A>G 3289;0|107 Hom;A>G 4411;0|161 Het;A>G 1126;79|52 12 32943927 -1.93 Y N Het;C>T 284;9|12 Het;C>T 156;12|8 Hom;C>T 95;0|4 12 32944158 -1.93 Y N Het;-A 1190;53|34 Het;-A 872;33|25 Hom;-A 2518;1|57 12 32944162 -1.93 Y N Het;C>T 1253;53|34 Het;C>T 881;33|23 Hom;C>T 2528;1|57 12 32944546 -1.93 Y N Het;G>A 629;26|30 Het;G>A 795;33|35 Hom;G>A 2493;0|92 12 32945107 -1.93 Y N Het;G>C 1173;94|56 Het;G>C 1025;85|48 Hom;G>C 3879;0|139 12 32945495 -1.93 Y N Het;C>T 664;37|25 Het;C>T 855;23|32 Hom;C>T 1781;0|54 12 32945721 -1.93 Y N Het;G>T 1737;80|71 Het;G>T 1269;55|57 Hom;G>T 3124;2|114 12 32945769 -1.93 Y N Het;G>C 1002;45|39 Het;G>C 740;22|28 Hom;G>C 1028;0|35 12 32945835 -1.93 Y N Het;G>A 514;19|16 Het;G>A 143;6|5 Hom;G>A 407;0|11 12 32948969 -1.93 Y N Het;-A 269;10|8 Ref Hom;-A 188;0|5 12 32948971 -1.93 Y N Het;C>T 278;10|8 Ref Hom;C>T 197;0|5 12 33049781 -1.94 Y N Het;G>A 91;6|4 Ref Hom;G>A 219;0|6 12 38573689 -2.87 N Y Ref Het;T>C 437;7|16 Het;T>C 103;14|8 12 39233771 -2.81 Y N Het;A>G 426;6|20 Ref Hom;A>G 1091;0|42 12 40301611 -2.72 Y N Het;C>T 1366;70|62 Ref Hom;C>T 5116;2|178 12 40634158 -2.69 Y N Het;T>C 162;1|5 Ref Hom;T>C 127;0|4 12 40740835 -2.68 Y N Het;T>G 267;4|8 Het;T>G 196;2|6 Hom;T>G 287;0|7 12 40873763 -2.67 N Y Het;G>A 1465;85|64 Het;G>A 1464;95|63 Het;G>A 1621;100|73 12 40900819 -2.67 Y N Het;A>G 1713;53|75 Het;A>G 1266;47|56 Hom;A>G 3584;0|130 12 40908265 -2.67 Y N Het;A>G 4266;40|128 Het;A>G 2524;130|70 Hom;A>G 5397;1|178 12 40917312 -2.67 Y N Het;C>T 1375;40|56 Ref Hom;C>T 2501;0|83 12 40920110 -2.67 Y N Het;T>C 2363;88|107 Het;T>C 1897;87|94 Hom;T>C 5613;2|214 12 40922104 -2.67 Y N Het;A>C 1146;84|57 Ref Hom;A>C 3789;0|135 12 40925908 -2.66 Y N Het;A>C 818;44|33 Het;A>C 972;26|44 Hom;A>C 2157;0|74 12 40927890 -2.66 Y N Het;T>G 904;33|38 Ref Hom;T>G 2127;0|68 12 40930709 -2.66 Y N Het;G>C 470;11|19 Het;G>C 290;22|16 Hom;G>C 1654;0|63 12 40952934 -2.66 Y N Het;A>G 69;6|3 Het;A>G 112;5|4 Hom;A>G 322;0|10 12 41014371 -2.66 Y N Het;G>C 421;17|16 Het;G>C 344;14|12 Hom;G>C 592;0|20 12 41582590 -2.64 Y N Het;G>C 365;9|10 Ref Hom;G>C 1021;0|24 12 41582603 -2.64 Y N Het;G>C 371;7|10 Ref Hom;G>C 996;0|23 12 41588124 -2.64 Y N Het;A>G 566;20|19 Ref Hom;A>G 740;0|19 12 41949370 -2.65 Y N Het;T>G 198;3|7 Ref Hom;T>G 609;0|16 12 41957568 -2.65 Y N Het;C>T 393;9|14 Het;C>T 210;8|8 Hom;C>T 685;0|23 12 42554505 -2.65 N Y Hom;A>G 2701;1|94 Hom;A>G 3005;0|107 Het;A>G 1221;83|58 12 43819298 -2.21 N Y Het;G>A 1204;47|57 Hom;G>A 2610;0|91 Het;G>A 612;30|29 12 43962575 -2.13 Y N Het;T>C 345;7|12 Ref Hom;T>C 589;0|23 12 43963009 -2.13 Y N Het;G>A 987;36|42 Ref Hom;G>A 2172;0|74 12 43965171 -2.13 Y N Het;T>G 648;41|30 Ref Hom;T>G 1880;0|63 12 43965280 -2.13 Y N Het;T>C 1086;46|46 Ref Hom;T>C 2762;0|99 12 44130123 -2.04 Y N Het;-A 281;9|13 Ref Hom;-A 464;0|17 12 44132250 -2.04 Y N Het;T>A 305;30|18 Ref Hom;T>A 1109;2|42 12 44139805 -2.03 Y N Het;A>T 423;7|15 Ref Hom;A>T 774;0|27 12 44148259 -2.03 Y N Het;T>C 2206;72|95 Ref Hom;T>C 7747;2|292 12 44963781 -1.80 Y N Het;C>T 553;24|28 Het;C>T 260;65|20 Hom;C>T 2338;2|90 12 44963798 -1.80 Y Y Het;G>C 486;25|24 Het;G>C 206;58|16 Hom;G>C 2133;2|77 12 45000786 -1.79 Y N Het;C>A 42;1|2 Ref Hom;C>A 88;0|3 12 45059237 -1.77 Y N Het;T>G 482;37|22 Ref Hom;T>G 3005;2|103 12 46215163 -1.59 Y N Het;G>A 511;11|23 Het;G>A 390;21|20 Hom;G>A 1247;0|47 12 46591906 -1.60 N Y Ref Het;T>C 251;13|12 Ref 12 46777400 -1.61 Y N Het;+GAGGAGGCGGG 172;7|6 Ref Hom;+GAGGAGGCGGG 323;0|7 12 47336910 -1.70 Y N Het;C>T 301;23|17 Ref Hom;C>T 1993;0|76 12 48151822 -2.27 Y N Het;C>G 650;46|29 Ref Hom;C>G 1883;0|69 12 48182087 -2.30 Y N Het;C>T 595;9|22 Het;C>T 403;7|15 Hom;C>T 1072;0|36 12 48195939 -2.31 N Y Hom;G>C 947;0|30 Het;G>C 464;15|21 Het;G>C 595;15|22 12 48272895 -2.38 Y N Het;A>G 1972;74|85 Het;A>G 1317;99|67 Hom;A>G 3174;0|113 12 48377970 -2.48 Y N Het;A>G 956;52|46 Het;A>G 677;33|31 Hom;A>G 1881;0|66 12 48386553 -2.49 Y N Het;A>G 153;5|6 Het;A>G 242;3|9 Hom;A>G 218;0|6 12 48386577 -2.49 Y N Het;G>T 304;12|14 Het;G>T 307;9|14 Hom;G>T 390;0|15 12 48389643 -2.49 Y N Het;A>C 842;51|38 Het;A>C 785;29|33 Hom;A>C 2433;0|88 12 48398002 -2.50 Y N Het;G>C 1772;104|82 Het;G>C 1959;68|88 Hom;G>C 4321;0|157 12 48398080 -2.50 Y N Het;T>A 2150;117|108 Het;T>A 2741;77|123 Hom;T>A 5221;0|197 12 48537624 -2.62 Y N Het;A>G 2719;109|112 Ref Hom;A>G 6157;2|230 12 48578325 -2.66 Y N Het;A>C 2011;94|87 Ref Hom;A>C 4282;0|152 12 48738555 -2.81 Y N Het;-A 353;20|19 Het;-A 179;22|12 Hom;-A 816;0|33 12 48741219 -2.81 Y N Het;A>T 78;1|3 Ref Hom;A>T 214;0|7 12 48888594 -2.87 N Y Het;C>T 985;63|44 Het;C>T 1022;64|52 Het;C>T 1049;52|47 12 49298340 -2.86 Y N Het;C>T 141;12|7 Het;C>T 130;12|7 Hom;C>T 375;0|15 12 49334598 -2.86 Y N Het;C>T 110;5|5 Ref Hom;C>T 323;0|7 12 50233256 -2.83 N Y Ref Het;G>A 2159;110|98 Het;G>A 2428;157|120 12 50344976 -2.79 Y N Het;G>A 868;43|40 Het;G>A 1181;51|55 Hom;G>A 3031;0|116 12 50345711 -2.79 Y N Het;C>G 938;41|45 Het;C>G 722;28|32 Hom;C>G 1502;0|53 12 50351075 -2.79 Y N Het;T>C 1120;37|44 Het;T>C 980;49|44 Hom;T>C 2301;0|77 12 50616346 -2.63 Y N Het;A>G 96;8|4 Ref Hom;A>G 127;0|4 12 51404467 -2.19 N Y Ref Ref Het;C>T 360;24|20 12 51582188 -2.09 Y N Het;T>C 1855;90|88 Ref Hom;T>C 4090;0|152 12 52163248 -1.56 Y N Het;A>G 283;2|8 Ref Hom;A>G 137;0|4 12 52242123 -1.48 Y N Het;A>G 419;17|19 Het;A>G 349;20|15 Hom;A>G 1241;0|47 12 52263869 -1.46 N Y Het;T>A 90;4|6 Ref Ref 12 52284668 -1.44 Y N Het;C>A 4676;214|207 Ref Hom;C>A 11510;3|434 12 52285209 -1.44 Y N 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Het;A>G 480;19|18 Hom;A>G 602;0|17 12 80650276 1.29 Y N Het;+CAAA 450;2|12 Ref Hom;+CAAA 1875;0|43 12 80665397 1.29 Y N Het;A>G 483;17|16 Het;A>G 215;14|8 Hom;A>G 679;0|20 12 80690919 1.29 Y N Het;T>C 237;3|7 Ref Hom;T>C 249;0|7 12 80707153 1.29 Y N Het;C>T 309;11|11 Het;C>T 208;4|9 Hom;C>T 448;0|15 12 80712519 1.29 Y N Het;T>A 187;4|7 Ref Hom;T>A 502;0|16 12 80730466 1.29 Y N Het;G>A 175;6|7 Het;G>A 345;8|12 Hom;G>A 761;0|21 12 80752660 1.29 Y N Het;A>G 249;11|11 Het;A>G 462;15|17 Hom;A>G 678;0|23 12 80760470 1.29 Y N Het;-T 541;49|28 Het;-T 637;44|32 Hom;-T 1984;0|70 12 80761465 1.29 Y N Het;G>A 1344;54|62 Het;G>A 1271;76|65 Hom;G>A 4258;0|157 12 80765741 1.29 Y N Het;C>T 1094;44|46 Het;C>T 1115;35|46 Hom;C>T 3062;0|107 12 80904143 1.29 Y N Het;T>C 1719;91|80 Ref Hom;T>C 7432;0|285 12 80935300 1.29 Y N Het;A>T 332;16|13 Het;A>T 297;15|13 Hom;A>T 910;0|30 12 81329536 1.29 Y N Het;A>C 120;17|8 Ref Hom;A>C 457;0|19 12 81627238 1.29 Y N Het;C>T 339;34|17 Ref Hom;C>T 4126;0|150 12 81653313 1.29 Y N Het;C>G 214;10|9 Ref Hom;C>G 593;0|19 12 81655913 1.29 Y N Het;C>T 75;17|5 Ref Hom;C>T 588;0|19 12 81672956 1.29 Y N Het;T>A 480;28|23 Ref Hom;T>A 1612;1|62 12 81696487 1.29 N Y Ref Het;G>A 888;20|39 Ref 12 81769581 1.29 Y N Het;C>T 993;33|45 Ref Hom;C>T 2789;2|103 12 82751100 1.28 Y Y Het;G>A 873;47|34 Ref Hom;G>A 2407;0|79 12 83080737 1.28 Y N Het;C>T 123;9|8 Het;C>T 193;6|10 Hom;C>T 349;0|13 12 83875440 1.27 N Y Het;C>T 135;16|9 Hom;C>T 1249;2|50 Ref 12 84525723 1.27 Y N Het;T>C 69;10|5 Het;T>C 105;6|5 Hom;T>C 360;0|15 12 84525754 1.27 Y N Het;C>T 97;13|6 Het;C>T 261;10|11 Hom;C>T 504;0|19 12 85257445 1.26 Y N Het;A>G 296;13|13 Ref Hom;A>G 273;0|9 12 86094787 1.25 Y N Het;A>T 87;7|5 Ref Hom;A>T 451;0|11 12 86094788 1.25 Y N Het;A>T 87;7|5 Ref Hom;A>T 451;0|11 12 86095479 1.25 N Y Ref Het;G>A 135;5|5 Ref 12 86272378 1.25 Y N Het;A>T 390;13|19 Ref Hom;A>T 1545;0|59 12 86428350 1.25 Y N Het;+T 613;11|28 Ref Hom;+T 2147;0|77 12 87133120 1.25 Y N Het;G>T 78;2|3 Ref Hom;G>T 928;0|32 12 87332490 1.24 Y N Het;G>T 901;33|39 Ref Hom;G>T 1738;0|63 12 88214458 1.24 Y N Het;C>T 418;7|18 Ref Hom;C>T 802;4|32 12 88228515 1.24 N Y Het;A>G 483;20|23 Hom;A>G 2743;0|103 Ref 12 88440676 1.23 Y N Het;G>C 1429;75|65 Ref Hom;G>C 8260;0|299 12 88546982 1.23 Y N Het;A>G 185;7|6 Ref Hom;A>G 306;0|8 12 89405665 1.19 Y N Het;A>C 1109;77|49 Ref Hom;A>C 4153;2|142 12 89745477 1.17 Y Y Het;C>A 632;30|29 Het;C>A 390;24|20 Hom;C>A 1428;0|51 12 89813410 1.17 Y N Het;G>T 153;2|5 Ref Hom;G>T 137;0|4 12 89814685 1.17 Y N Het;-TCACT 3765;95|99 Ref Hom;-TCACT 8952;0|205 12 89870512 1.16 Y N Het;-AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAC 80;3|3 Ref Hom;-AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAC 213;0|6 12 89885648 1.16 Y N Het;G>T 192;10|8 Ref Hom;G>T 426;0|14 12 89917349 1.16 Y N Het;C>T 2602;77|108 Ref Hom;C>T 4367;0|155 12 90147264 1.14 Y N Het;C>A 404;15|16 Het;C>A 161;4|8 Hom;C>A 568;0|20 12 90147434 1.14 Y N Het;T>C 302;7|10 Het;T>C 51;14|4 Hom;T>C 302;0|12 12 90443482 1.12 N Y Het;A>G 1820;80|88 Hom;A>G 2975;0|110 Ref 12 90689015 1.10 Y N Het;-TTTAT 133;6|8 Ref Hom;-TTTAT 176;0|8 12 90689347 1.10 Y N Het;G>A 546;18|22 Ref Hom;G>A 1074;0|34 12 91445303 0.95 N Y Ref Het;G>A 1281;37|56 Ref 12 91502250 0.94 Y N Het;A>G 1678;67|65 Ref Hom;A>G 3593;0|115 12 91625695 0.91 Y N Het;A>G 60;14|6 Ref Hom;A>G 1629;0|63 12 92539344 -0.03 Y N Het;T>C 1261;48|55 Het;T>C 843;43|40 Hom;T>C 2858;0|102 12 92819139 -0.58 N Y Hom;A>C 1699;0|54 Het;A>C 428;13|18 Het;A>C 754;17|33 12 93150102 -1.32 N Y Het;T>C 1104;42|48 Het;T>C 778;35|39 Het;T>C 678;39|35 12 93873089 -2.11 Y N Het;+A 130;7|9 Ref Hom;+A 137;0|7 12 94108172 -2.19 Y N Het;A>G 127;4|5 Ref Hom;A>G 193;0|6 12 94108529 -2.19 N Y Het;G>A 2799;124|120 Het;G>A 1911;164|95 Het;G>A 2582;183|128 12 94253033 -2.26 N Y Het;T>A 468;17|17 Het;T>A 381;8|15 Het;T>A 348;5|13 12 94352781 -2.28 Y N Het;A>C 98;15|7 Ref Hom;A>C 335;0|12 12 94562802 -2.25 Y N Het;G>A 58;6|3 Het;G>A 287;8|12 Hom;G>A 441;0|12 12 94562875 -2.25 Y N Het;C>G 931;37|37 Het;C>G 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-1.18 Y N Het;C>T 1927;104|85 Ref Hom;C>T 4578;2|167 12 128434832 -1.18 Y N Het;C>T 1993;95|83 Ref Hom;C>T 4184;1|149 12 128435050 -1.18 Y N Het;C>T 1944;71|78 Ref Hom;C>T 5777;0|208 12 128435349 -1.18 Y N Het;G>A 444;8|13 Ref Hom;G>A 1253;0|32 12 128435371 -1.18 Y N Het;G>A 251;5|7 Ref Hom;G>A 870;0|19 12 128435676 -1.18 Y N Het;A>G 423;40|23 Ref Hom;A>G 1895;0|69 12 128435779 -1.18 Y N Het;C>T 291;23|17 Ref Hom;C>T 969;0|34 12 128435790 -1.18 Y N Het;-G 129;21|7 Ref Hom;-G 891;0|26 12 128435814 -1.18 Y N Het;A>G 155;19|7 Ref Hom;A>G 706;0|22 12 128435979 -1.18 Y N Het;C>A 71;8|5 Ref Hom;C>A 211;0|9 12 128602631 -1.23 N Y Hom;A>G 1825;0|56 Het;A>G 497;23|22 Hom;A>G 1427;0|47 12 128656569 -1.28 Y N Het;+A 122;9|7 Ref Hom;+A 110;0|5 12 128900005 -2.17 N Y Het;G>A 2689;124|123 Ref Het;G>A 2503;113|121 12 129100970 -1.42 N Y Het;A>G 348;15|12 Het;A>G 344;11|14 Ref 12 129189556 -1.47 Y N Het;T>C 369;16|12 Het;T>C 68;6|3 Hom;T>C 479;0|15 12 129189941 -1.47 Y Y Het;G>A 1236;75|56 Het;G>A 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