Chr Position LOD score Is GP compatible Is marker 302_Male_Control Quality;R|A_302_Male_Control 401_Male_Control Quality;R|A_401_Male_Control 402_Male_Patient Quality;R|A_402_Male_Patient 3 402273 -0.62 Y N Het;+T 148;4|10 Ref Hom;+T 206;0|10 3 898801 -0.63 N Y Het;G>C 261;10|13 Ref Ref 3 1424850 -0.84 N Y Het;T>G 478;35|23 Hom;T>G 1531;0|51 Hom;T>G 1836;1|63 3 2152057 -2.20 N Y Ref Het;G>C 432;22|15 Het;G>C 506;14|18 3 2404329 -2.68 N Y Ref Ref Het;C>T 81;7|6 3 3030223 -2.54 N Y Ref Het;C>A 978;27|39 Het;C>A 684;40|30 3 3102867 -2.69 N Y Het;C>T 1145;63|59 Ref Ref 3 3133791 -2.74 Y N Het;G>A 257;1|9 Het;G>A 135;6|5 Hom;G>A 493;0|15 3 3189398 -2.80 N Y Het;A>G 1005;42|45 Het;A>G 1291;49|57 Het;A>G 1132;42|53 3 3571367 -2.74 N Y Het;A>G 368;5|15 Het;A>G 397;20|18 Het;A>G 293;24|15 3 4023868 -2.05 Y N Het;A>G 478;22|22 Het;A>G 875;33|42 Hom;A>G 2183;0|79 3 4024235 -2.05 Y N Het;G>A 98;19|6 Het;G>A 333;16|16 Hom;G>A 490;0|18 3 4024446 -2.05 Y N Het;C>G 480;24|20 Het;C>G 220;9|10 Hom;C>G 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430;7|16 Hom;T>A 675;0|20 3 50223977 -1.63 Y N Het;C>T 799;14|29 Het;C>T 470;14|18 Hom;C>T 894;0|31 3 50224225 -1.63 Y N Het;A>G 387;26|17 Het;A>G 435;32|21 Hom;A>G 1181;0|45 3 50289853 -1.63 Y N Het;C>T 2151;103|95 Het;C>T 1249;61|58 Hom;C>T 3240;2|116 3 50329715 -1.62 Y N Het;C>A 965;49|42 Het;C>A 813;40|40 Hom;C>A 1636;0|61 3 50380132 -1.62 Y N Het;G>A 703;23|24 Het;G>A 160;6|8 Hom;G>A 269;0|8 3 50382811 -1.62 Y N Het;C>T 348;11|13 Het;C>T 98;10|5 Hom;C>T 700;0|20 3 50553156 -1.62 Y N Het;A>G 65;6|3 Het;A>G 86;4|5 Hom;A>G 455;0|13 3 50685574 -1.62 Y N Het;-A 124;5|6 Het;-A 235;7|10 Hom;-A 220;0|8 3 51274902 -1.60 Y N Het;+A 339;12|12 Het;+A 334;25|13 Hom;+A 1653;0|43 3 51978640 -1.59 Y N Het;G>A 661;15|21 Het;G>A 241;18|10 Hom;G>A 782;0|26 3 51980193 -1.59 Y N Het;C>T 1751;64|76 Het;C>T 1060;53|50 Hom;C>T 3088;2|111 3 52097060 -1.59 Y N Het;C>T 1114;65|48 Het;C>T 1108;25|40 Hom;C>T 2183;0|80 3 52109841 -1.59 Y N Het;T>C 223;12|11 Het;T>C 167;12|7 Hom;T>C 573;0|18 3 52172214 -1.59 Y N Het;G>A 1580;68|71 Het;G>A 1431;85|67 Hom;G>A 3619;2|132 3 52188308 -1.59 Y N Het;T>C 492;18|21 Het;T>C 245;16|14 Hom;T>C 1216;0|47 3 52228496 -1.58 Y N Het;T>C 150;2|5 Ref Hom;T>C 196;0|7 3 52232979 -1.58 Y N Het;+TTTAC 364;9|11 Het;+TTTAC 137;12|5 Hom;+TTTAC 715;0|17 3 52236762 -1.58 Y N Het;G>A 564;10|24 Het;G>A 482;4|21 Hom;G>A 1402;0|52 3 52237970 -1.58 Y N Het;C>T 1136;93|59 Het;C>T 903;70|46 Hom;C>T 3148;0|119 3 52238656 -1.58 Y N Het;T>C 133;11|5 Het;T>C 259;8|10 Hom;T>C 259;0|8 3 52238677 -1.58 Y N Het;C>T 177;15|7 Het;C>T 268;13|11 Hom;C>T 515;0|18 3 52256697 -1.58 Y N Het;C>T 1963;126|91 Het;C>T 2302;72|99 Hom;C>T 4503;2|163 3 52258372 -1.58 Y N Het;T>C 136;11|5 Het;T>C 241;6|8 Hom;T>C 558;0|16 3 52266175 -1.58 Y N Het;T>A 551;17|15 Het;T>A 536;8|14 Hom;T>A 647;0|15 3 52266176 -1.58 Y N Het;C>A 551;17|15 Het;C>A 536;7|14 Hom;C>A 647;0|15 3 52322797 -1.58 Y N Het;A>G 1792;107|73 Het;A>G 2155;101|92 Hom;A>G 4590;1|156 3 52325759 -1.58 Y N Het;A>G 1852;78|73 Het;A>G 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1976;111|92 Het;T>C 1544;98|73 Hom;T>C 4600;2|170 3 52556890 -1.58 Y N Het;A>G 2814;113|115 Het;A>G 2956;83|124 Hom;A>G 5878;0|213 3 52557038 -1.58 Y N Het;C>T 2915;126|135 Het;C>T 2670;85|119 Hom;C>T 5460;0|200 3 52558008 -1.58 Y N Het;T>C 2074;79|88 Het;T>C 1792;89|80 Hom;T>C 4361;3|156 3 52558133 -1.58 Y N Het;T>C 4113;228|184 Het;T>C 3372;203|163 Hom;T>C 8792;3|331 3 52558904 -1.58 Y N Het;A>T 2042;104|85 Het;A>T 1271;92|58 Hom;A>T 4106;4|149 3 52561779 -1.58 Y N Het;C>T 2394;76|94 Het;C>T 1793;74|77 Hom;C>T 3319;2|116 3 52568805 -1.58 Y N Het;G>T 185;4|7 Het;G>T 76;6|5 Hom;G>T 248;0|8 3 52584431 -1.58 Y N Het;+CTC 973;27|26 Het;+CTC 879;7|21 Hom;+CTC 1531;0|33 3 52584715 -1.58 Y N Het;A>G 833;34|31 Het;A>G 784;36|30 Hom;A>G 1395;0|46 3 52584787 -1.58 Y N Het;T>C 849;38|36 Het;T>C 816;38|38 Hom;T>C 1697;0|66 3 52610415 -1.58 Y N Het;T>C 152;4|5 Ref Hom;T>C 172;0|5 3 52610651 -1.58 Y N Het;T>A 1310;51|58 Het;T>A 1348;54|65 Hom;T>A 2631;1|97 3 52621211 -1.58 Y N Het;T>A 68;11|4 Het;T>A 58;5|3 Hom;T>A 229;0|7 3 52621627 -1.58 Y N Het;C>T 155;2|6 Het;C>T 154;5|7 Hom;C>T 126;0|4 3 52637486 -1.58 Y N Het;C>G 73;6|3 Het;C>G 111;6|5 Hom;C>G 544;0|18 3 52643307 -1.58 Y N Het;A>G 567;17|22 Het;A>G 828;24|31 Hom;A>G 2101;0|72 3 52643685 -1.58 Y N Het;T>C 1539;97|73 Het;T>C 1533;103|73 Hom;T>C 5630;0|204 3 52676190 -1.57 Y N Het;A>C 167;4|6 Ref Hom;A>C 162;0|5 3 52692124 -1.57 Y N Het;G>A 256;7|11 Het;G>A 72;7|5 Hom;G>A 208;0|7 3 52692359 -1.57 Y N Het;C>G 486;13|21 Het;C>G 94;12|5 Hom;C>G 760;0|25 3 52720080 -1.57 Y N Het;A>C 898;21|38 Het;A>C 379;40|21 Hom;A>C 1619;0|58 3 52721305 -1.57 Y N Het;G>A 1321;69|65 Het;G>A 1223;68|60 Hom;G>A 2684;2|105 3 52722266 -1.57 Y N Het;-T 47;2|4 Het;-T 65;3|5 Hom;-T 244;0|11 3 52726695 -1.57 Y N Het;C>T 611;23|24 Het;C>T 152;21|7 Hom;C>T 1063;0|35 3 52727257 -1.57 Y N Het;G>A 1627;87|67 Het;G>A 1672;86|76 Hom;G>A 4095;0|148 3 52728312 -1.57 Y N Het;+T 424;19|23 Het;+T 292;28|20 Hom;+T 848;3|38 3 52728804 -1.57 Y N Het;C>T 192;6|7 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350;0|9 3 158980279 -2.25 Y N Het;A>G 538;29|19 Het;A>G 127;25|8 Hom;A>G 1227;1|43 3 158991724 -2.25 Y N Het;A>T 413;21|20 Het;A>T 563;26|27 Hom;A>T 1233;0|48 3 159486139 -2.41 Y N Het;A>G 1301;36|48 Het;A>G 1164;50|49 Hom;A>G 3179;0|111 3 159557953 -2.44 Y N Het;T>C 700;25|29 Het;T>C 432;23|21 Hom;T>C 1096;0|43 3 159744438 -2.51 N Y Hom;C>T 5341;0|120 Hom;C>T 4642;0|104 Het;C>T 1333;56|37 3 159924899 -2.58 Y N Het;A>T 963;41|44 Het;A>T 949;41|40 Hom;A>T 2595;0|92 3 161017192 -2.71 N Y Het;G>A 444;19|21 Hom;G>A 1016;0|37 Het;G>A 205;16|12 3 161144525 -2.71 Y N Het;+A 892;51|58 Het;+A 798;43|49 Hom;+A 2229;15|109 3 162071771 -2.67 Y N Het;T>G 118;3|7 Het;T>G 282;15|13 Hom;T>G 601;0|22 3 162219685 -2.67 Y N Het;-GATTGATT 86;1|3 Ref Hom;-GATTGATT 323;0|8 3 162271618 -2.67 Y N Het;G>T 63;6|3 Ref Hom;G>T 138;0|5 3 162271702 -2.67 Y N Het;T>C 437;22|20 Het;T>C 260;4|13 Hom;T>C 853;0|31 3 162771666 -2.65 Y N Het;A>T 65;11|3 Ref Hom;A>T 554;0|12 3 162771685 -2.65 Y N Het;C>T 178;13|8 Ref Hom;C>T 603;0|15 3 162771733 -2.65 Y N Het;G>C 420;27|19 Het;G>C 160;19|9 Hom;G>C 1375;0|52 3 162771907 -2.65 Y N Het;G>A 248;12|10 Het;G>A 405;3|17 Hom;G>A 837;0|29 3 162954568 -2.65 Y N Het;G>A 621;22|28 Het;G>A 664;16|30 Hom;G>A 1301;0|45 3 162996196 -2.64 Y N Het;T>C 109;5|4 Het;T>C 107;5|4 Hom;T>C 305;0|8 3 163889384 -2.63 N Y Ref Het;T>C 170;12|9 Het;T>C 349;27|20 3 164239383 -2.63 Y N Het;A>G 356;26|18 Het;A>G 233;31|12 Hom;A>G 1937;0|70 3 164239539 -2.63 Y N Het;T>C 158;9|7 Het;T>C 84;11|5 Hom;T>C 413;0|14 3 165281103 -2.61 Y N Het;T>C 301;22|18 Het;T>C 279;16|14 Hom;T>C 765;0|28 3 165331691 -2.61 Y N Het;G>C 156;3|5 Het;G>C 184;6|6 Hom;G>C 216;0|6 3 166005307 -2.62 Y N Het;-A 270;9|19 Het;-A 166;13|12 Hom;-A 398;3|22 3 167023738 -2.71 N Y Hom;G>C 1875;0|58 Het;G>C 1012;49|42 Het;G>C 1071;44|43 3 167639672 -2.76 N Y Ref Ref Het;C>G 199;15|8 3 168520843 -2.72 N Y Hom;G>A 2026;0|67 Het;G>A 760;42|34 Het;G>A 1040;46|46 3 169244930 -2.67 Y N Het;G>T 188;5|9 Het;G>T 139;7|7 Hom;G>T 210;0|9 3 169381024 -2.68 Y N Het;C>A 427;7|14 Het;C>A 157;1|6 Hom;C>A 232;0|9 3 169540397 -2.69 N Y Hom;T>C 7169;0|233 Hom;T>C 4865;0|163 Het;T>C 2055;94|90 3 170522227 -2.75 N Y Ref Ref Het;A>G 91;7|5 3 171242076 -2.34 Y N Het;+CTGCTG 373;3|10 Ref Hom;+CTGCTG 187;0|5 3 171768074 -2.54 N Y Het;A>G 1316;37|61 Het;A>G 414;35|22 Het;A>G 850;39|42 3 172059121 -2.73 N Y Het;G>A 469;14|17 Het;G>A 329;11|12 Het;G>A 263;9|10 3 172766822 -2.36 N Y Ref Ref Het;G>A 1481;75|74 3 173113680 -2.03 Y N Het;C>G 42;2|3 Ref Hom;C>G 71;0|4 3 174095188 -2.07 Y N Het;G>A 857;50|42 Ref Hom;G>A 2269;0|88 3 174099247 -2.07 N Y Het;G>C 353;15|17 Het;G>C 560;26|22 Ref 3 174496239 -2.20 Y N Het;+A 727;61|25 Ref Hom;+A 4530;2|112 3 174496241 -2.20 Y N Het;C>T 736;60|20 Ref Hom;C>T 4539;2|92 3 174496242 -2.20 Y N Het;+AAT 619;60|20 Ref Hom;+AAT 4013;2|92 3 174496244 -2.20 Y N Het;-AGG 616;61|19 Ref Hom;-AGG 4013;2|90 3 174496248 -2.20 Y N Het;+AAC 583;58|19 Ref Hom;+AAC 3923;2|90 3 174496250 -2.20 Y N Het;T>A 592;59|19 Ref Hom;T>A 3932;2|83 3 174496331 -2.20 Y N Het;G>A 142;14|6 Ref Hom;G>A 676;0|20 3 174830294 -2.27 N Y Het;T>A 310;15|13 Hom;T>A 1799;0|64 Het;T>A 1120;54|55 3 175165201 -2.30 Y N Het;T>G 247;16|11 Het;T>G 254;7|9 Hom;T>G 927;0|29 3 175185060 -2.30 Y N Het;T>G 198;4|6 Het;T>G 129;7|5 Hom;T>G 741;0|19 3 175189406 -2.30 Y N Het;-T 1428;55|40 Het;-T 1264;26|35 Hom;-T 2432;0|54 3 175189417 -2.30 Y N Het;G>A 1529;63|45 Het;G>A 952;33|40 Hom;G>A 2718;0|67 3 175189447 -2.30 Y N Het;G>A 1336;82|61 Het;G>A 1456;66|62 Hom;G>A 2375;2|97 3 175189718 -2.30 Y N Het;A>G 359;8|11 Het;A>G 187;6|6 Hom;A>G 213;0|6 3 175319437 -2.31 Y N Het;A>G 177;15|8 Het;A>G 88;2|4 Hom;A>G 484;2|19 3 175319685 -2.31 Y N Het;C>T 140;2|5 Ref Hom;C>T 140;0|5 3 175345143 -2.31 Y Y Het;C>G 178;11|9 Het;C>G 506;33|25 Hom;C>G 2031;0|78 3 175920884 -2.27 N Y Het;G>T 403;14|15 Ref Het;G>T 315;7|14 3 176403499 -2.21 Y N Het;A>G 258;17|9 Het;A>G 167;13|8 Hom;A>G 620;0|17 3 176533083 -2.18 Y Y Het;A>T 2235;157|106 Het;A>T 2681;127|125 Hom;A>T 6085;0|221 3 176533245 -2.18 Y N Het;-T 2363;77|91 Het;-T 2112;77|82 Hom;-T 5502;0|173 3 176533356 -2.18 Y N Het;T>C 1928;63|79 Het;T>C 1795;109|86 Hom;T>C 5048;0|174 3 176534014 -2.18 Y N Het;+T 862;27|21 Het;+T 887;14|23 Hom;+T 1575;0|32 3 176534019 -2.18 Y N Het;A>G 862;30|25 Het;A>G 887;17|23 Hom;A>G 1728;0|44 3 176534860 -2.18 Y N Het;-AT 426;9|12 Ref Hom;-AT 277;0|8 3 176684959 -2.15 Y N Het;T>C 174;13|7 Het;T>C 263;13|12 Hom;T>C 555;0|18 3 176684998 -2.15 Y N Het;C>T 96;6|4 Het;C>T 236;10|8 Hom;C>T 122;0|4 3 178174699 -2.13 N Y Hom;C>A 1167;0|33 Het;C>A 444;26|17 Het;C>A 346;23|14 3 178474804 -2.06 Y N Het;T>C 1422;60|56 Het;T>C 1549;53|63 Hom;T>C 4042;2|139 3 178976591 -1.94 Y N Het;T>A 257;2|8 Het;T>A 112;2|4 Hom;T>A 195;0|6 3 178976777 -1.94 Y Y Het;C>T 1699;95|71 Het;C>T 2007;91|90 Hom;C>T 4225;0|150 3 178976821 -1.94 Y N Het;G>A 2236;109|92 Het;G>A 2055;110|93 Hom;G>A 5619;0|199 3 178977111 -1.94 Y N Het;G>T 1870;95|82 Het;G>T 1859;99|84 Hom;G>T 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