Chr Position LOD score Is GP compatible Is marker 302_Male_Control Quality;R|A_302_Male_Control 401_Male_Control Quality;R|A_401_Male_Control 402_Male_Patient Quality;R|A_402_Male_Patient 4 51709 -1.23 Y N Het;C>A 73;2|3 Het;C>A 335;7|17 Hom;C>A 505;0|21 4 755025 -1.23 Y N Het;G>A 913;45|37 Het;G>A 835;38|38 Hom;G>A 1809;2|66 4 759709 -1.23 Y N Het;A>G 399;8|15 Het;A>G 153;8|6 Hom;A>G 429;0|14 4 759733 -1.23 Y N Het;T>C 533;15|21 Het;T>C 209;14|8 Hom;T>C 771;0|26 4 786401 -1.23 Y Y Het;T>C 1291;54|55 Het;T>C 897;45|41 Hom;T>C 2658;2|98 4 786508 -1.23 Y N Het;T>C 149;7|7 Het;T>C 229;8|10 Hom;T>C 287;0|8 4 818440 -1.28 Y N Het;G>A 505;17|18 Het;G>A 250;19|10 Hom;G>A 664;0|22 4 892082 -1.40 Y N Het;-GCA 212;15|7 Het;-GCA 245;11|8 Hom;-GCA 773;0|18 4 1078124 -1.70 Y N Het;G>A 121;2|6 Ref Hom;G>A 120;0|6 4 1191423 -1.89 Y N Het;-T 1224;38|40 Het;-T 791;22|26 Hom;-T 2006;0|55 4 1193832 -1.89 Y N Het;C>T 407;31|18 Het;C>T 436;15|17 Hom;C>T 707;0|25 4 1204377 -1.91 Y N Het;-C 816;31|35 Het;-C 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110;6|5 Het;C>T 119;2|5 Hom;C>T 184;0|8 4 36460271 -2.76 Y N Het;A>T 327;3|13 Het;A>T 223;9|11 Hom;A>T 208;0|9 4 36460352 -2.76 Y N Het;G>A 829;10|27 Het;G>A 322;18|18 Hom;G>A 1484;0|48 4 36509363 -2.77 Y N Het;G>A 78;4|4 Het;G>A 159;8|9 Hom;G>A 337;0|14 4 36509434 -2.77 Y N Het;A>T 47;1|3 Het;A>T 38;2|2 Hom;A>T 170;0|8 4 36595252 -2.78 Y N Het;C>T 118;11|5 Het;C>T 102;4|4 Hom;C>T 613;0|18 4 37021693 -2.72 N Y Ref Het;A>C 1327;76|64 Het;A>C 1814;111|88 4 37592674 -2.59 Y N Het;T>C 224;12|11 Het;T>C 248;15|11 Hom;T>C 576;0|22 4 37903756 -2.79 N Y Het;T>C 738;41|31 Hom;T>C 2179;0|78 Het;T>C 693;34|33 4 38138856 -2.65 N Y Het;G>A 730;36|33 Ref Het;G>A 988;41|45 4 38189148 -2.61 Y N Het;C>T 60;6|3 Ref Hom;C>T 130;0|4 4 38626282 -2.29 Y N Het;T>C 3179;130|136 Het;T>C 1381;111|68 Hom;T>C 6549;2|237 4 38932922 -2.15 N Y Het;C>A 171;4|6 Ref Ref 4 39448542 -2.06 Y N Het;C>G 3038;94|83 Het;C>G 1959;53|80 Hom;C>G 4461;0|154 4 39456392 -2.06 Y N Het;G>A 284;14|12 Het;G>A 287;11|13 Hom;G>A 959;0|35 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Het;C>G 304;20|16 Hom;C>G 563;0|22 4 42069029 -2.75 N Y Het;T>C 902;44|32 Ref Het;T>C 892;40|37 4 42965159 -2.67 Y N Het;A>C 401;28|22 Het;A>C 646;53|33 Hom;A>C 2366;0|83 4 43032612 -2.66 N Y Het;G>A 1319;39|57 Ref Het;G>A 906;47|44 4 43082724 -2.66 Y N Het;C>T 822;97|50 Het;C>T 826;87|47 Hom;C>T 2570;0|101 4 43094956 -2.66 Y N Het;T>C 36;6|3 Ref Hom;T>C 256;0|11 4 43132704 -2.65 Y N Het;-T 944;72|51 Het;-T 1656;86|84 Hom;-T 4145;1|159 4 44976804 -2.52 Y N Het;T>C 134;8|7 Het;T>C 237;10|12 Hom;T>C 202;0|8 4 45578847 -2.48 Y N Het;C>T 176;3|6 Het;C>T 134;9|6 Hom;C>T 365;0|11 4 46042945 -2.46 Y N Het;C>T 72;1|3 Het;C>T 204;9|9 Hom;C>T 528;0|18 4 46066356 -2.46 Y N Het;C>T 353;7|11 Het;C>T 317;6|10 Hom;C>T 483;0|15 4 46086060 -2.46 Y N Het;T>C 395;32|22 Het;T>C 1019;56|53 Hom;T>C 2390;0|91 4 46305733 -2.45 Y N Het;T>C 1342;59|57 Het;T>C 998;56|45 Hom;T>C 3546;0|123 4 46314367 -2.45 Y N Het;A>G 364;11|12 Het;A>G 113;5|4 Hom;A>G 220;0|6 4 46314593 -2.45 Y Y Het;T>C 2147;118|99 Het;T>C 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Y N Het;C>T 258;15|10 Het;C>T 155;12|8 Hom;C>T 413;0|13 4 54967709 -2.66 N Y Het;C>A 762;17|32 Ref Het;C>A 455;13|21 4 55706585 -2.34 Y N Het;G>T 296;18|16 Het;G>T 263;21|14 Hom;G>T 988;0|38 4 55955232 -2.25 N Y Het;T>C 529;12|23 Het;T>C 387;7|17 Ref 4 56734701 -2.30 Y Y Het;C>T 1182;41|51 Het;C>T 1469;32|62 Hom;C>T 3466;0|129 4 56763170 -2.30 Y N Het;A>G 343;15|13 Het;A>G 193;3|8 Hom;A>G 445;0|13 4 57189498 -2.71 N Y Ref Het;G>A 191;11|8 Het;G>A 78;10|5 4 57450848 -2.71 Y N Het;A>C 450;13|16 Het;A>C 472;9|16 Hom;A>C 673;0|24 4 57516896 -2.71 N Y Het;G>A 744;59|39 Ref Het;G>A 1370;67|67 4 57624037 -2.71 Y N Het;G>A 531;27|25 Het;G>A 165;25|10 Hom;G>A 1531;0|58 4 58015591 -2.73 Y N Het;T>C 104;4|4 Het;T>C 158;1|5 Hom;T>C 181;0|5 4 58221648 -2.74 Y N Het;A>G 164;2|5 Het;A>G 276;7|9 Hom;A>G 261;0|7 4 58293597 -2.74 N Y Het;A>G 372;33|16 Hom;A>G 1758;0|63 Het;A>G 431;19|20 4 58425541 -2.75 Y N Het;C>T 68;4|3 Het;C>T 70;4|3 Hom;C>T 374;0|11 4 58931763 -2.75 Y N Het;T>A 55;2|3 Ref Hom;T>A 150;0|6 4 58984145 -2.76 Y N Het;C>T 63;13|6 Het;C>T 113;6|8 Hom;C>T 556;0|23 4 59906337 -2.73 N Y Ref Het;C>T 1717;91|84 Het;C>T 1681;136|89 4 60312678 -2.64 Y N Het;T>A 504;30|24 Het;T>A 1178;44|56 Hom;T>A 3320;0|126 4 60312892 -2.64 Y N Het;T>C 95;2|4 Het;T>C 92;2|4 Hom;T>C 128;0|5 4 60812634 -2.52 N Y Hom;T>G 917;0|31 Het;T>G 295;13|13 Het;T>G 428;23|18 4 61112775 -2.45 Y N Het;-GA 264;20|11 Het;-GA 802;25|29 Hom;-GA 1785;0|53 4 62992668 -1.97 Y N Het;+A 55;3|4 Het;+A 33;2|3 Hom;+A 243;0|9 4 63023051 -1.97 N Y Het;G>A 291;24|15 Het;G>A 872;43|41 Ref 4 64523108 -1.91 Y Y Het;C>A 507;39|26 Het;C>A 918;100|53 Hom;C>A 4073;4|163 4 64573303 -1.91 Y N Het;C>T 65;4|3 Het;C>T 117;5|5 Hom;C>T 266;0|8 4 64773209 -1.91 Y N Het;G>C 43;11|4 Het;G>C 250;17|12 Hom;G>C 1208;0|42 4 64873012 -1.90 Y N Het;T>G 208;4|8 Het;T>G 163;4|6 Hom;T>G 264;0|8 4 64873213 -1.90 Y N Het;A>T 1283;22|53 Het;A>T 1062;45|51 Hom;A>T 3338;0|126 4 64873355 -1.90 Y N Het;G>A 73;1|3 Het;G>A 73;1|3 Hom;G>A 160;0|5 4 65375128 -1.92 Y N Het;-T 205;13|14 Ref Hom;-T 589;0|28 4 66218728 -1.96 Y N Het;C>T 233;11|13 Het;C>T 676;29|30 Hom;C>T 1820;0|68 4 67142620 -2.05 Y N Het;G>A 393;10|16 Het;G>A 596;15|25 Hom;G>A 1022;2|38 4 67142703 -2.05 Y N Het;G>C 111;2|4 Ref Hom;G>C 88;0|3 4 68436883 -2.30 Y N Het;T>C 1383;61|60 Het;T>C 1804;53|79 Hom;T>C 3844;0|142 4 68458937 -2.30 Y N Het;G>C 824;42|36 Het;G>C 929;25|36 Hom;G>C 1806;0|61 4 68620957 -2.35 Y N Het;T>C 1796;39|65 Het;T>C 1076;52|46 Hom;T>C 3403;0|120 4 68621197 -2.35 Y N Het;A>G 2188;63|87 Het;A>G 1684;71|69 Hom;A>G 3977;1|140 4 68621308 -2.35 Y N Het;A>G 2062;69|62 Het;A>G 1884;69|54 Hom;A>G 5365;0|134 4 68621332 -2.35 Y N Het;C>T 1688;61|48 Het;C>T 1822;62|52 Hom;C>T 4893;0|116 4 68621550 -2.35 Y N Het;G>A 311;17|14 Het;G>A 392;22|19 Hom;G>A 1063;0|41 4 68621585 -2.35 Y N Het;-A 342;20|20 Het;-A 383;24|22 Hom;-A 1262;2|54 4 70048146 -2.66 Y N Het;G>A 146;8|7 Het;G>A 1347;15|33 Hom;G>A 1441;0|39 4 70152685 -2.67 N Y Het;C>G 684;20|27 Ref Het;C>G 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76943677 -2.62 Y N Het;G>A 505;20|20 Het;G>A 737;13|30 Hom;G>A 1199;0|34 4 76943764 -2.62 Y N Het;-T 145;15|9 Het;-T 271;15|14 Hom;-T 882;0|33 4 76944491 -2.62 Y N Het;T>C 404;20|18 Het;T>C 677;29|29 Hom;T>C 1441;0|48 4 76955914 -2.62 Y N Het;T>C 1139;35|52 Het;T>C 779;49|40 Hom;T>C 2588;2|99 4 76956188 -2.62 Y N Het;T>C 1228;30|33 Het;T>C 595;37|27 Hom;T>C 2797;0|81 4 76956289 -2.62 Y N Het;+AA 2711;60|70 Het;+AA 2614;84|71 Hom;+AA 7113;0|164 4 76956528 -2.62 Y N Het;A>G 772;28|30 Het;A>G 731;36|30 Hom;A>G 2306;0|74 4 76956630 -2.62 Y N Het;A>T 164;4|6 Het;A>T 105;2|4 Hom;A>T 239;0|7 4 76957171 -2.62 Y N Het;C>T 2132;77|98 Het;C>T 1494;65|76 Hom;C>T 3243;2|122 4 76996958 -2.62 Y N Het;G>A 177;6|7 Het;G>A 94;9|5 Hom;G>A 405;0|12 4 76997258 -2.62 Y N Het;T>C 105;2|4 Het;T>C 64;3|3 Hom;T>C 224;0|7 4 77021433 -2.62 Y N Het;C>T 2706;125|125 Het;C>T 3008;114|137 Hom;C>T 6063;1|228 4 77053562 -2.62 Y N Het;C>T 104;2|4 Ref Hom;C>T 83;0|3 4 77177817 -2.61 Y N Het;A>G 42;2|2 Het;A>G 123;2|5 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Het;A>G 969;28|43 Het;A>G 600;22|29 Hom;A>G 2043;0|75 4 83838262 -2.73 N Y Het;G>T 2411;97|102 Hom;G>T 5110;0|184 Het;G>T 2241;129|104 4 84240680 -2.05 N Y Het;G>T 597;19|22 Hom;G>T 1318;0|49 Het;G>T 599;28|27 4 84367050 -1.78 N Y Het;G>A 235;9|9 Het;G>A 236;6|8 Ref 4 84458001 -1.75 Y N Het;A>G 739;24|29 Het;A>G 490;29|23 Hom;A>G 1326;0|49 4 84458028 -1.75 Y N Het;C>G 582;16|21 Het;C>G 382;27|16 Hom;C>G 895;0|32 4 84465613 -1.74 Y N Het;C>T 932;37|35 Het;C>T 616;29|27 Hom;C>T 1721;0|56 4 84465855 -1.74 Y N Het;A>C 856;25|27 Het;A>C 668;31|22 Hom;A>C 1277;0|33 4 85164141 -1.53 Y N Het;+A 246;2|13 Het;+A 288;2|13 Hom;+A 78;0|5 4 85164403 -1.53 Y N Het;+AAACATTGAATGTTTT 889;27|24 Het;+AAACATTGAATGTTTT 573;30|19 Hom;+AAACATTGAATGTTTT 1523;0|39 4 85540814 -1.49 N Y Het;T>C 124;7|5 Het;T>C 151;7|6 Ref 4 86937588 -1.39 N Y Het;G>C 206;71|19 Het;G>C 329;51|22 Ref 4 87797861 -1.36 Y N Het;T>C 891;41|36 Het;T>C 873;30|34 Hom;T>C 1659;0|51 4 87808810 -1.36 Y N Het;+CA 149;8|5 Het;+CA 346;9|8 Hom;+CA 718;0|15 4 87836005 -1.36 Y N Het;T>C 42;4|3 Ref Hom;T>C 153;0|6 4 88052219 -1.35 Y N Het;T>C 744;44|32 Het;T>C 633;36|29 Hom;T>C 2050;0|71 4 88053085 -1.35 Y N Het;C>T 262;29|12 Het;C>T 427;25|17 Hom;C>T 1007;0|34 4 88056719 -1.35 Y N Het;-T 1090;34|51 Het;-T 619;40|32 Hom;-T 1704;0|64 4 88226480 -1.35 Y N Het;A>C 414;18|18 Het;A>C 563;11|23 Hom;A>C 1835;0|64 4 88226572 -1.35 Y N Het;C>T 73;5|4 Ref Hom;C>T 456;0|14 4 88898941 -1.35 Y Y Het;C>T 1247;79|65 Het;C>T 1273;36|59 Hom;C>T 2337;1|88 4 89015857 -1.34 Y N Het;C>T 433;18|20 Het;C>T 166;13|9 Hom;C>T 630;1|27 4 89016782 -1.34 Y N Het;A>G 488;10|21 Het;A>G 270;14|14 Hom;A>G 1164;0|43 4 89018565 -1.34 Y N Het;A>G 380;13|16 Het;A>G 412;14|16 Hom;A>G 685;0|21 4 89022362 -1.34 Y N Het;C>T 991;48|42 Het;C>T 617;32|31 Hom;C>T 2986;0|110 4 89261908 -1.35 N Y Het;T>C 529;13|18 Het;T>C 321;14|12 Ref 4 89711849 -1.37 Y N Het;T>C 119;7|4 Het;T>C 251;22|9 Hom;T>C 984;0|26 4 89711854 -1.37 Y N Het;C>T 125;5|4 Het;C>T 221;14|7 Hom;C>T 670;0|16 4 89726073 -1.37 Y N Het;T>A 95;6|4 Het;T>A 127;7|6 Hom;T>A 233;0|9 4 89726283 -1.37 Y N Het;A>C 157;4|7 Het;A>C 156;5|5 Hom;A>C 363;0|11 4 89744242 -1.37 Y N Het;T>C 963;52|46 Het;T>C 510;34|28 Hom;T>C 2114;0|80 4 90169925 -1.40 Y Y Het;A>G 1821;101|81 Het;A>G 1272;62|59 Hom;A>G 4133;0|144 4 91073943 -1.56 Y N Het;G>A 543;36|29 Het;G>A 854;51|45 Hom;G>A 2098;2|83 4 91234250 -1.58 Y N Het;A>G 272;4|9 Het;A>G 107;7|5 Hom;A>G 482;0|14 4 91489566 -1.62 N Y Het;T>C 733;55|34 Het;T>C 195;37|12 Ref 4 94316763 -2.62 N Y Het;T>G 537;35|23 Hom;T>G 2786;0|99 Het;T>G 1171;62|53 4 95040022 -2.68 Y N Het;C>A 388;36|20 Het;C>A 1322;48|62 Hom;C>A 3114;0|115 4 95129238 -2.69 Y N Het;T>C 664;42|29 Het;T>C 678;25|26 Hom;T>C 1500;0|50 4 95173779 -2.69 Y N Het;T>C 332;26|15 Het;T>C 433;11|17 Hom;T>C 1050;0|38 4 95197520 -2.69 Y N Het;C>T 1041;26|47 Het;C>T 518;44|26 Hom;C>T 2415;0|90 4 95206252 -2.70 Y N Het;-TATC 2949;69|77 Het;-TATC 1961;70|55 Hom;-TATC 6625;0|151 4 95211610 -2.70 Y N Het;T>C 2407;71|95 Het;T>C 2497;143|110 Hom;T>C 7543;0|266 4 95503902 -2.72 N Y Ref Het;T>C 2464;93|112 Het;T>C 2966;115|139 4 96075965 -2.73 N Y Hom;C>T 1411;0|47 Het;C>T 177;19|8 Het;C>T 450;26|21 4 96306740 -2.72 Y N Het;G>A 731;26|33 Het;G>A 703;34|35 Hom;G>A 1896;0|67 4 96356759 -2.70 N Y Het;A>G 147;8|8 Ref Het;A>G 347;28|18 4 97662454 -2.52 N Y Het;T>G 686;15|31 Het;T>G 422;21|21 Ref 4 99679279 -2.60 Y N Het;G>A 171;27|11 Het;G>A 498;22|21 Hom;G>A 1146;0|34 4 100047929 -2.67 N Y Het;G>A 1125;49|49 Hom;G>A 2391;0|78 Het;G>A 1145;33|46 4 100123776 -2.68 Y N Het;C>A 215;8|9 Het;C>A 374;10|15 Hom;C>A 731;0|25 4 100124716 -2.68 Y N Het;C>G 972;34|41 Het;C>G 1820;69|76 Hom;C>G 3996;0|141 4 100131163 -2.68 Y N Het;G>C 126;3|6 Het;G>C 223;5|8 Hom;G>C 485;0|13 4 100134713 -2.68 Y N Het;+T 841;17|25 Het;+T 564;24|18 Hom;+T 1417;0|36 4 100137534 -2.69 Y N Het;G>C 530;16|16 Het;G>C 107;15|5 Hom;G>C 652;0|20 4 101337150 -2.73 N Y Het;C>T 480;29|20 Ref Het;C>T 424;13|26 4 101696012 -2.73 Y N Het;T>G 491;14|19 Het;T>G 453;9|19 Hom;T>G 1176;0|43 4 102267453 -2.71 Y N Het;G>A 91;6|5 Ref Hom;G>A 148;0|6 4 102268034 -2.71 Y N Het;+CGCCGC 522;16|15 Het;+CGCCGC 320;4|9 Hom;+CGCCGC 1252;0|29 4 102268940 -2.70 Y N Het;T>C 957;32|38 Het;T>C 623;26|24 Hom;T>C 1452;0|46 4 102370183 -2.70 Y N Het;C>T 32;2|2 Het;C>T 84;4|5 Hom;C>T 158;0|7 4 103174491 -2.68 N Y Het;A>G 295;13|12 Ref Het;A>G 643;25|28 4 103225513 -2.68 Y N Het;T>C 1151;45|52 Het;T>C 1666;98|80 Hom;T>C 4842;1|178 4 103228734 -2.68 Y N Het;C>T 548;70|31 Het;C>T 983;71|49 Hom;C>T 3060;0|110 4 103765156 -2.66 Y N Het;A>G 2005;97|89 Het;A>G 1112;77|51 Hom;A>G 3413;1|119 4 104063071 -2.66 Y N Het;C>T 1851;67|85 Het;C>T 1228;70|61 Hom;C>T 3364;2|127 4 104066049 -2.66 Y N Het;C>T 257;2|8 Het;C>T 75;1|3 Hom;C>T 158;0|5 4 104066890 -2.66 Y N Het;T>A 592;36|25 Het;T>A 815;33|33 Hom;T>A 1709;2|59 4 104079424 -2.66 Y N Het;C>T 241;14|10 Het;C>T 394;33|19 Hom;C>T 1325;0|47 4 104082349 -2.66 Y N Het;C>T 1091;47|52 Het;C>T 1620;75|73 Hom;C>T 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338;10|12 Het;T>C 327;10|11 Hom;T>C 820;0|28 4 107156365 -2.61 Y N Het;C>G 403;10|16 Het;C>G 546;5|17 Hom;C>G 900;0|26 4 108356216 -2.68 Y N Het;T>C 756;45|39 Het;T>C 1145;80|59 Hom;T>C 4247;2|163 4 108397888 -2.68 Y N Het;C>T 185;7|10 Het;C>T 78;5|4 Hom;C>T 360;0|15 4 108404696 -2.68 Y N Het;+A 117;13|7 Het;+A 137;7|7 Hom;+A 573;0|20 4 108788838 -2.71 N Y Ref Het;A>G 517;15|23 Het;A>G 593;16|22 4 109338854 -2.73 Y N Het;G>A 39;2|2 Ref Hom;G>A 150;0|6 4 109478108 -2.73 N Y Het;C>G 1293;59|57 Hom;C>G 3448;0|117 Het;C>G 1630;49|73 4 109708777 -2.73 N Y Ref Het;A>G 474;42|26 Het;A>G 656;24|30 4 110351219 -2.71 Y N Het;-A 70;8|7 Het;-A 116;4|13 Hom;-A 229;2|14 4 110914427 -2.71 N Y Het;A>T 903;35|43 Ref Het;A>T 744;56|39 4 111409705 -2.71 N Y Het;T>C 603;50|28 Hom;T>C 3420;0|124 Het;T>C 1329;67|59 4 111412391 -2.71 Y N Het;-T 61;9|7 Ref Hom;-T 172;1|11 4 111510631 -2.70 Y N Het;G>C 347;10|14 Het;G>C 151;7|7 Hom;G>C 414;0|13 4 111558411 -2.70 Y N Het;G>C 179;11|9 Ref Hom;G>C 812;0|32 4 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1437;54|60 Het;T>C 1119;50|51 Hom;T>C 3193;1|120 4 190838545 -1.51 N Y Ref Het;T>C 271;13|13 Ref